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【韓国人にだけ存在する６万個のＤＮＡ、クラウド利用で発見】

韓国人に特徴的に現れる遺伝子変異がクラウドコンピューティング技術で明らかになった。
ＫＴは非営利研究法人のゲノム研究財団、バイオ企業のテラジェンイーテックスと共同で、
韓国人２０人の遺伝子解読と分析に成功したと７日に明らかにした。
ゲノム研究財団とテラジェンイーテックスが進める「韓国人個人ゲノムプロジェクト（ＫＰＧＰ）」の一環として
２０人の韓国人ゲノムを分析するのにＫＴがクラウドコンピューティング技術を提供した結果だ。

人間の遺伝子は３０億個の塩基で構成されており、今回のプロジェクトを通じて８７６万個の遺伝子変異を発見した。
このうち１８４万個は既に発見されたものと違い今回新たに発見された変異だった。
その中でも６万３０００個余りの変異は２０人のうち１３人から共通して発見されたもので、韓国人特有の遺伝子変異と解釈される。

こうしてわかった韓国人特有の変異は、病気に関連した遺伝子から身体特性に関するものまで多様だった。
代表的なものが辛い味を好む韓国人の特異的変異だ。２０人中６人から共通で発見された変異で、
唐辛子の辛さの成分のカプサイシンによって活性化するたんぱく質と関連があることが明らかになった。
この変異によって機能が変わったたんぱく質が辛い味を好む韓国人の食生活習慣を説明する端緒になると予想される。
また、味噌・キムチのように醗酵食品が好きな韓国人の特異な趣向遺伝子も出てきた。

テラジェンイーテックスのパク・ジョンファ博士は、
「世界的に３００件余りのヒトゲノム解読結果が公開されているが、
大部分が西洋人やアフリカ人、一部東洋人のもので、韓国人に対する遺伝情報は不備だった。
今回６万個余りの韓国人共通変異を発見したことにより韓国人のためのゲノム解読が可能になった」と説明した。

韓国人に対するゲノム分析結果は２００８年１２月から始まった。
嘉泉医大のキム・ソンジン教授が韓国人ゲノムを初めて完全解読し、
７月にはマクロジェンが韓国人１８人のゲノムを分析して英国の著名学術誌の「ネイチャージェネティクス」に発表した。
今回行われた韓国人２０人のゲノム分析はこれまでに行われたプロジェクトで最多人員だ。

今回のプロジェクトの特徴は韓国人遺伝子変異を明らかにするのにクラウドコンピューティング技術を初めて導入した点だ。
ヒトゲノムに存在する３０億個の塩基配列情報量は１２０ギガバイトに達するが、
通常１人の塩基配列情報を分析し結果を保存するのに８コア級サーバー１０台を１週間稼働させなければならない。
しかしクラウドコンピューティングサービスを活用すれば
ハードウェアを増設しなくても大規模コンピューティング資源をいつでも必要なだけ利用することができる。
２００８年に６カ月かかった作業を今回は４０日で終わらせたのが目立った成果だ。

ＫＴとテラジェンイーテックスはさらに多くの韓国人ゲノム分析のため現在７０人の血液サンプルを確保した状態だ。
ＫＴのオ・セヒョン新事業戦略担当常務は、
「多数のゲノムデータが集まってこそ個人オーダーメード型医療に必要な情報を知ることができ、
これを調べるのにクラウドコンピューティングのようなシステムは重要な道具だ」と話した。


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http://japanese.donga.com/srv/service.php3?biid=2003021117138

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http://japanese.donga.com/srv/service.php3?biid=2004021674158

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